驗(yàn)證稽查和常規(guī)稽查、專項(xiàng)稽查并列為海關(guān)三種企業(yè)稽查方式，與其他稽查方式相比，驗(yàn)證稽查具有四個方面的特殊性：
   “工作目標(biāo)”特殊。驗(yàn)證稽查是海關(guān)分類管理工作的配套措施，其工作目標(biāo)體現(xiàn)為，一方面，通過評估驗(yàn)證企業(yè)守法狀況或貿(mào)易安全情況，有針對性規(guī)范企業(yè)內(nèi)部經(jīng)營管理，引導(dǎo)企業(yè)守法自律，保障其更好地享受海關(guān)監(jiān)管便利。另一方面，優(yōu)化海關(guān)監(jiān)管資源配置，減輕海關(guān)一線監(jiān)管現(xiàn)場進(jìn)出口通關(guān)壓力，提高海關(guān)整體把關(guān)服務(wù)水平。
  “管理對象”特殊。根據(jù)《分類管理辦法》的規(guī)定，“已適用A類管理1年以上”且“上一年度進(jìn)出口總值3000萬美元（中西部地區(qū)1000萬美元）以上”的企業(yè)才具備申請?jiān)u“AA類”的資格。驗(yàn)證稽查的管理對象就是這些具備條件的申請?jiān)u為或已經(jīng)評為AA類的企業(yè)。除AA類企業(yè)之外，驗(yàn)證稽查還承擔(dān)了對申請AEO企業(yè)的貿(mào)易安全驗(yàn)證工作。
  “管理方式”特殊。驗(yàn)證稽查采取“事前準(zhǔn)入驗(yàn)證”與“后續(xù)監(jiān)控管理”有機(jī)結(jié)合，也即“前驗(yàn)后管”，對企業(yè)進(jìn)行全面深入的管理：一方面海關(guān)在企業(yè)評定為“AA類”等級之前對其進(jìn)行準(zhǔn)入式稽查，驗(yàn)證企業(yè)是否符合海關(guān)管理要求；另一方面在企業(yè)評定為AA類管理等級后，海關(guān)將在進(jìn)出口通關(guān)過程中給予企業(yè)充分便利，因此有必要在后續(xù)管理環(huán)節(jié)在日常監(jiān)控基礎(chǔ)上，開展驗(yàn)證稽查等措施對企業(yè)進(jìn)行管理，以確保AA類企業(yè)的進(jìn)出口活動不脫離海關(guān)監(jiān)管。
   “驗(yàn)證內(nèi)容”特殊。驗(yàn)證稽查不僅要驗(yàn)證企業(yè)的守法狀況，還要驗(yàn)證其貿(mào)易安全情況。隨著我國對外經(jīng)濟(jì)貿(mào)易的發(fā)展和海關(guān)貿(mào)易安全國際認(rèn)證合作（如AEO認(rèn)證、C-TPAT認(rèn)證等）的深化，“反恐”、“維護(hù)國際供應(yīng)鏈貿(mào)易安全”等非傳統(tǒng)職能日漸成為中國海關(guān)的主要工作內(nèi)容，而驗(yàn)證稽查通過審核企業(yè)貿(mào)易安全情況，對企業(yè)的貿(mào)易安全情況作出客觀公正的等級評估和資質(zhì)認(rèn)證，這正是中國海關(guān)與國際接軌開展貿(mào)易安全互認(rèn)合作，為中國企業(yè)享受國際通關(guān)便利提供認(rèn)證服務(wù)的具體體現(xiàn)。

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