答案：在上述招標(biāo)投標(biāo)程序中，不妥之處包括： (1)在公開招標(biāo)中，對(duì)省內(nèi)的投標(biāo)人與省外的投標(biāo)人提出了不同的要求。因?yàn)楣_招標(biāo)應(yīng)當(dāng)平等地對(duì)待所有的投標(biāo)人，不允許對(duì)不同的投標(biāo)人提出不同的要求。 (2)提交投標(biāo)文件的截止時(shí)間，與舉行開標(biāo)會(huì)的時(shí)間不是同一時(shí)間。按照《招標(biāo)投標(biāo)法》的規(guī)定，開標(biāo)應(yīng)當(dāng)在招標(biāo)文件確定的提交投標(biāo)文件截止時(shí)間的同一時(shí)間公開進(jìn)行。 (3)開標(biāo)會(huì)由該省建委主持。開標(biāo)應(yīng)當(dāng)由招標(biāo)人或者招標(biāo)代理人主持，省建委作為行政管理機(jī)關(guān)只能監(jiān)督招標(biāo)投標(biāo)活動(dòng)，不能作為開標(biāo)會(huì)的主持人。 (4)中標(biāo)書在開標(biāo)三個(gè)月后一直未能發(fā)出。評(píng)標(biāo)工作不宜久拖不決，如果在評(píng)標(biāo)中出現(xiàn)無法克服的困難，應(yīng)當(dāng)及早采取其他措施(如宣布招標(biāo)失敗)。 (5)更改中標(biāo)金額和工程結(jié)算方式，確定某省某公司為中標(biāo)單位。如果不宣布招標(biāo)失敗，則招標(biāo)人和中標(biāo)人應(yīng)當(dāng)按照招標(biāo)文件和中標(biāo)人的投標(biāo)文件訂立書面合同，招標(biāo)人和中標(biāo)人不得再行訂立背離合同實(shí)質(zhì)性內(nèi)容的其他協(xié)議。E單位的投標(biāo)文件應(yīng)當(dāng)被認(rèn)為是無效投標(biāo)而拒絕。因?yàn)檎袠?biāo)文件規(guī)定的投標(biāo)保證金是投標(biāo)文件的組成部分，因此，對(duì)于未能按照要求提交投標(biāo)保證金的投標(biāo)(包括期限)，招標(biāo)單位將視為不響應(yīng)投標(biāo)而予以拒絕。對(duì)D單位撤回投標(biāo)文件的要求，應(yīng)當(dāng)沒收其投標(biāo)保證金。因?yàn)?，投?biāo)行為是一種要約，在投標(biāo)有效期內(nèi)撤回其投標(biāo)文件的，應(yīng)當(dāng)視為違約行為。因此，招標(biāo)單位可以沒收D單位的投標(biāo)保證金。問題久拖不決后，某醫(yī)院可以要求重新進(jìn)行招標(biāo)。

解析：(1) 一個(gè)工程只能編制一個(gè)標(biāo)底。如果在開標(biāo)后(即標(biāo)底公開后)再復(fù)核標(biāo)底，將導(dǎo)致具體的評(píng)標(biāo)條件發(fā)生變化。實(shí)際上屬于招標(biāo)單位的評(píng)標(biāo)準(zhǔn)備工作不夠充分。 (2) 問題久拖不決，使得各方面的條件發(fā)生變化。再按照最初招標(biāo)文件中設(shè)定的條件訂立合同是不公平的。如果重新進(jìn)行招標(biāo)，給投標(biāo)人造成的損失不能要求某醫(yī)院賠償。雖然重新招標(biāo)是由于招標(biāo)人的準(zhǔn)備工作不夠充分導(dǎo)致的，但并非屬于欺詐等違反誠實(shí)信用的行為。而招在合同訂立中僅僅是要約邀請(qǐng)，對(duì)招標(biāo)人不具有合同意義上的約束力，招標(biāo)并不能保證投標(biāo)人中標(biāo)，投標(biāo)的費(fèi)用應(yīng)當(dāng)由投標(biāo)人自己承擔(dān)。